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Gut:肠道微生物标记有望诊断结直肠癌

根据一项最新研究结果,肠道菌群中的某些菌株与结直肠癌相关,可以作为一种非侵入性、准确、节约成本的诊断试验。相关内容在线发表于 Gut 上。

“虽然之前已有研究发现肠道菌群与结直肠癌之间的关系,但研究结果未达成一致。据我们所知,我们的研究首次尝试收集现有的微生物标记基因数据并统一处理,” 德克萨斯大学公共卫生学院 Manasi S. Shah 博士说。“尽管队列人口、实验室方法和后续分析有统计学差异,对微生物结果有影响,令人鼓舞的是,我们发现细菌信号显著与大肠癌相关。”

Shah 及其同事对 2012 年到 2016 年之间发表的 9 项研究进行了荟萃分析,采用不同的实验方法来评估结直肠癌和肠道微生物之间的关系。为了识别一组共同的特征性微生物标志物,他们评估了来自不同种族人群 509 份粪便样本的原始 16S rRNA 基因序列数据(79 例大肠腺瘤,195 例 CRC,235 例对照者)。

他们还比较了两种不同的生物信息学方法以处理数据:常用的封闭参考操作分类单元分配方法,以及新型菌株特异性方法。

与 CRC 有关的的特定微生物菌种包括 Parvimonas MICRA ATCC 33270,咽峡炎链球菌和几种变形菌门。整个研究中,与对照组相比,这些在来自 CRC 患者的粪便样本中“频繁和显着增加”。

与对照分类相比,使用这些微生物标志物分类显示,封闭参考操作分类单元分配方法 AUROC 为 76.6%,菌株特异性方法 80.3%。当结合微生物标志物与临床特点、分类准确率超过 80%,两种方法的 AUROC 分别为 83.3% 和 91.3%。

“微生物研究为先进的诊断和治疗提供了巨大的潜能。对于某些疾病,确定微生物为基础的联系已经相对简单。然而,对于大多数人,研究界仍然是通过筛查我们设法了解的有关微生物如何影响疾病发生和进展、为我们提供快速、准确诊断的数据,”贝勒医学院病理学和免疫学助理教授 Emily B. Hollister 博士说。“微生物与结直肠癌联系统一模式的识别代表了这些努力的重要一步。”


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    Gut:肠道微生物标记有望诊断结直肠癌

    根据一项最新研究结果,肠道菌群中的某些菌株与结直肠癌相关,可以作为一种非侵入性、准确、节约成本的诊断试验。相关内容在线发表于 Gut 上。

    “虽然之前已有研究发现肠道菌群与结直肠癌之间的关系,但研究结果未达成一致。据我们所知,我们的研究首次尝试收集现有的微生物标记基因数据并统一处理,” 德克萨斯大学公共卫生学院 Manasi S. Shah 博士说。“尽管队列人口、实验室方法和后续分析有统计学差异,对微生物结果有影响,令人鼓舞的是,我们发现细菌信号显著与大肠癌相关。”

    Shah 及其同事对 2012 年到 2016 年之间发表的 9 项研究进行了荟萃分析,采用不同的实验方法来评估结直肠癌和肠道微生物之间的关系。为了识别一组共同的特征性微生物标志物,他们评估了来自不同种族人群 509 份粪便样本的原始 16S rRNA 基因序列数据(79 例大肠腺瘤,195 例 CRC,235 例对照者)。

    他们还比较了两种不同的生物信息学方法以处理数据:常用的封闭参考操作分类单元分配方法,以及新型菌株特异性方法。

    与 CRC 有关的的特定微生物菌种包括 Parvimonas MICRA ATCC 33270,咽峡炎链球菌和几种变形菌门。整个研究中,与对照组相比,这些在来自 CRC 患者的粪便样本中“频繁和显着增加”。

    与对照分类相比,使用这些微生物标志物分类显示,封闭参考操作分类单元分配方法 AUROC 为 76.6%,菌株特异性方法 80.3%。当结合微生物标志物与临床特点、分类准确率超过 80%,两种方法的 AUROC 分别为 83.3% 和 91.3%。

    “微生物研究为先进的诊断和治疗提供了巨大的潜能。对于某些疾病,确定微生物为基础的联系已经相对简单。然而,对于大多数人,研究界仍然是通过筛查我们设法了解的有关微生物如何影响疾病发生和进展、为我们提供快速、准确诊断的数据,”贝勒医学院病理学和免疫学助理教授 Emily B. Hollister 博士说。“微生物与结直肠癌联系统一模式的识别代表了这些努力的重要一步。”