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液体活检新方法:利用血液进行高精度全面基因组分析

近日,日本国立癌症研究中心开发出了无需通过活检或手术采集组织、而是利用血液来进行高精度全面基因组分析的方法。这是液体活检(Liquid biopsy)检查技术中的一种新方法。该研究中心使用这种方法,成功检测出了可能会成为晚期胰腺癌治疗靶点的异常基因。这一成果有助于实现患者负担小而且效果好的个体化治疗。

国立癌症研究中心研究所癌症基因组科学研究领域负责人柴田龙弘与该部门负责人谷内田真一等人组成的研究小组此次通过验证证实,可利用10ng的微量血液循环游离DNA,通过新一代测序仪进行全面性的基因组分析。据介绍,以往的基因组分析最少需要200ng的DNA。血液循环DNA的含量很少,而且高度分裂,因此以前的技术很难利用血液循环DNA进行高精度的基因组分析。

捕捉可能会成为治疗靶点的异常基因
此次在研究中进行的尝试是,使用通过组织活检等方法诊断出胰腺癌患者的血液,来检测胰腺癌中频繁发现异常的基因,以及含有可能成为治疗靶点基因的胰腺癌异常基因组。

在胰腺癌中,人们发现通过使用手术标本来进行大规模基因组分析,可以频繁地检测出"KRAS"、"CDKN2A"、"TP53"、"SMAD4/DPC4"四种异常基因。其中,KRAS基因突变是致癌过程的最初阶段产生的基因组异常,95%以上的胰腺癌患者都会携带这种变异基因。

在检测出KRAS变异的病例中,患者的血液中通常会存在来源于肿瘤组织的血液循环DNA。此次以这种病例为主,针对48个病例,利用新一代测序仪分析了60种基因,包括胰腺癌中频繁出现变异的基因以及可能会成为治疗靶点的基因。

结果在所有病例中都检测出了1种以上的癌症体细胞突变基因。而且,在其中14(约占30%)个病例中发现了可能成为治疗靶的"PIK3CA"、"EGFR"、"ATM"等变异基因。

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    液体活检新方法:利用血液进行高精度全面基因组分析

    近日,日本国立癌症研究中心开发出了无需通过活检或手术采集组织、而是利用血液来进行高精度全面基因组分析的方法。这是液体活检(Liquid biopsy)检查技术中的一种新方法。该研究中心使用这种方法,成功检测出了可能会成为晚期胰腺癌治疗靶点的异常基因。这一成果有助于实现患者负担小而且效果好的个体化治疗。

    国立癌症研究中心研究所癌症基因组科学研究领域负责人柴田龙弘与该部门负责人谷内田真一等人组成的研究小组此次通过验证证实,可利用10ng的微量血液循环游离DNA,通过新一代测序仪进行全面性的基因组分析。据介绍,以往的基因组分析最少需要200ng的DNA。血液循环DNA的含量很少,而且高度分裂,因此以前的技术很难利用血液循环DNA进行高精度的基因组分析。

    捕捉可能会成为治疗靶点的异常基因
    此次在研究中进行的尝试是,使用通过组织活检等方法诊断出胰腺癌患者的血液,来检测胰腺癌中频繁发现异常的基因,以及含有可能成为治疗靶点基因的胰腺癌异常基因组。

    在胰腺癌中,人们发现通过使用手术标本来进行大规模基因组分析,可以频繁地检测出"KRAS"、"CDKN2A"、"TP53"、"SMAD4/DPC4"四种异常基因。其中,KRAS基因突变是致癌过程的最初阶段产生的基因组异常,95%以上的胰腺癌患者都会携带这种变异基因。

    在检测出KRAS变异的病例中,患者的血液中通常会存在来源于肿瘤组织的血液循环DNA。此次以这种病例为主,针对48个病例,利用新一代测序仪分析了60种基因,包括胰腺癌中频繁出现变异的基因以及可能会成为治疗靶点的基因。

    结果在所有病例中都检测出了1种以上的癌症体细胞突变基因。而且,在其中14(约占30%)个病例中发现了可能成为治疗靶的"PIK3CA"、"EGFR"、"ATM"等变异基因。